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CafeMol 是本组开发并使用的分子动力学软件, 目前基于 svn 进行代码管理。 对于年轻人来说, git 可能是比较熟悉的选择。 本文展示了使用 git 来参与开发的可能性。

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本文用一个简单的应用例子来展示如何在 emacs org-mode 中使用 ledger 来进行个人财务管理。

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开源项目

py_sdvb

一个傻傻的 terminal 里面可以使用的字典软件。 可以比较方便地进行正则表达式搜索。

esnippets

快速输入必备法宝。 我自己的 Emacs snippets for yasnippet.

PyWMLogo

一个简单的生成 content logo 的小工具。 输出格式是 svg.

pinang

为分析 PDB 及 CafeMol 轨迹等写的小工具。 代码结构比较完整, 应该易于扩展。

respac_batch

为 RESPAC 计算而写的小脚本, 一步到位计算简化模型中蛋白质的表面电荷分布。

spacemacs_layers

我自己的 spacemacs 配置 (init.el) 及额外的 layers。

cafemol-mode

为 Emacs 写的一个 major mode, 用来方便地浏览和修改 CafeMol input file.

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